全自动萃取仪是一套由液体处理平台衍生开发出的能够在无人值守情况下自动化运行固相萃取方法的固相萃取仪。包括固相萃取的活化、上样、清洗、洗脱步骤，以及样品的切换。现有的技术分为单通道固相萃取仪和多通道固相萃取仪。
全自动萃取仪的特点:一套成熟的全自动萃取仪应该满足自动化、模块化、经济化、平行化、功能化、扩展化、可靠化这几个特点。
1.自动化:一套完善的自动化萃取系统可以真正在无人值守的情况下完成固相萃取方法的应用。有些固相萃取仪仅仅能完成部分固相萃取的步骤，不能成为自动化固相萃取仪。
2.模块化:可以根据不同用户的应用切换不用的模块，完成不同固相萃取方法的应用，如双柱叠加。
3.经济化:一套成熟的自动萃取仪应该给客户提供经济化的后期使用体验。包括试剂、耗材如SPE小柱的选择。应该可以兼容市售的主流SPE小柱供应商的产品。
4.平行化:使用自动化萃取系统的客户往往希望能够平行处理，也就是同时处理多个样品，这种对平行化的要求可以体现在固相萃取的每个步骤，包括小柱活化、上样、清洗、洗脱。所谓平行处理也就是同时处理，有些仪器如Dionex公司的Autotrace型号在上样步骤并不能真正的达到平行处理。但是，在处理大体积样品时(200mL，甚至500mL以上样品)，在固相萃取四个步骤中，真正耗费时间的是上样环节，下表以处理一个样品为例。AutoTrace280平衡了萃取效率和仪器成本的综合因素，提供上样环节支持多6通道同时运行，其它步骤(活化、清洗、洗脱)单独运行的设计。
5.功能化:越来越多的实验室会针对各类样品进行前处理，包括食品、药品、农业、环境等相关领域。客户希望能够在同一平台完成常规样品和大体积样品的处理。
6.扩展化:扩展性是从软件和硬件上。从软件上，拥有一个比较开放、自由的控制软件能够给客户的应用方案提供更多的可行性。从硬件上，实验室拥有品目繁多的各类实验用试管及容器，一套成熟的自动萃取仪应该能够给用户自动自定义管架的功能。就目前而言，只有少数厂家能够在软件和硬件上对这个应用提供支持，如美国吉尔森公司。
7.可靠化:自动化的仪器重要的特质就是稳定、可靠。这样才能发挥自动化的优势，将实验中的人为误差降至低。而软件则是其中的重要一环，有些厂家往往把各类功能集合在一起，这样反而由于功能模块的过多使得故障率偏高，往往一个模块如浓缩的问题导致整套系统瘫痪，十分影响到客户的正常应用。
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